ABSTRACT
El presente estudio evalua el gen de cloroplasto rbcL y la región espaciadora no codificante psbA-trnH de Arracacia xanthorrhiza como posible secuencia de código de barra. Se colectó material vegetal de A. xanthorrhiza en huertos de las provincias de Pichincha, Tungurahua y Cotopaxi, las cuales fueron sembradas en condiciones homogéneas en la Facultad de Ciencias Agropecuarias de la Universidad Técnica. El análisis del locus rbcL identificó los cinco materiales de A. xanthorrhiza con entre 97 y 99% de homología. La alineación de secuencias del locus rbcL y de psbA-trnH permitió diferenciar dos grupos, el primer grupo con SJ, QU, PP y B, observándose poca diversidad entre ellos, mientras que el segundo grupo está conformado por el material CH cultivado a 3260 m de altitud. En el segundo árbol, se demostró la divergencia entre los materiales colectados en diferentes provincias de la Sierra ecuatoriana, separándolos de acuerdo a su localidad, así como al color de la pulpa de la raíz. La región intergénica no codificadora (psbA-trnH) permitió identificar y obtener la diversidad genética de materiales cultivados de A. xanthorrhiza, provenientes de diversas zonas geográficas de la sierra ecuatoriana, con características morfológicas distintivas. Adicionalmente, esta secuencia pudo diferenciar a A. xanthorrhiza de otras especies de la familia Apiaceae, con lo cual se recomienda como código de barra.
The present study aimed to evaluate the Arracacia xanthorrhiza rbcL chloroplast gene and the non-coding spacer region psbA-trnH as a possible barcode sequence. Plant material of A. xanthorrhiza was collected in orchards of Pichincha, Tungurahua and Cotopaxi provinces. This material were cultivated in standard conditions in the la Facultad de Ciencias Agropecuarias de la Universidad Técnica. The rbcL locus analysis identified the five materials of A. xanthorrhiza with between 97 and 99% homology. The sequence alignment of rbcL locus and psbA-trnH allowed to differentiate two groups, the first group with SJ, QU, PP and B, showing low diversity among them, while the second group consisted of the CH material grown in 3260 m of altitude. In the second tree, the divergence between the materials collected in different provinces of the Ecuadorian Sierra was demonstrated, separating them according to their locality, as well as the color of the root pulp The non-coding intergenic region (psbA-trnH) allowed identify and obtain the genetic diversity of cultivated materials of A. xanthorrhiza, from various geographical areas of the Ecuadorian Sierra, with distinctive morphological characteristics. Additionally, this sequence was able to differentiate A. xanthorrhiza from other species of the Apiaceae family, which is recommended as a bar code.
ABSTRACT
La técnica de ADN polimórfico amplificado al azar (RAPD) fue utilizada en dos cultivares comerciales (Fonucla y UCLA-1) y 7 líneas (UCLA-249; UCLA-295; UCLA-37-1; UCLA-65; UCLA-83; UCLA-90; UCV-2) de ajonjolí (Sesamum indicum L) obtenidas por el programa de mejoramiento genético de la Universidad Centroccidental Lisandro Alvarado, Venezuela. Noventa y cuatro bandas polimórficas derivadas del uso de 12 deca-iniciadores indicaron un alto nivel de variabilidad. Tres de los iniciadores discriminaron 8 de los 9 materiales y, en combinación, pudieron resolverlos a todos. La probabilidad de que ocurrieran coincidencias idénticas fue de 5,22×10-29. El contenido de información de polimorfismo (CIP), el poder de resolución (PR) y el índice del marcador (IM) de cada iniciador no se correlacionaron de manera significativa con el número de genotipos resueltos. El coeficiente de similitud de Jaccard varió de 0,04 a 0,53. El agrupamiento realizado mediante UPGMA resultó en dos grupos principales relacionándose estrechamente con los grupos observados mediante el análisis de coordenadas principales (CP). Estos resultados demuestran que la técnica de RAPD es una herramienta útil para la identificación inequívoca de genotipos de ajonjolí y para evaluar la variabilidad de materiales genéticos usados en programas de mejoramiento genético